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      實時熒光定量PCR儀使用注意事項

      更新時間:2022-06-20      點擊次數:2060
        實時熒光定量PCR儀指的是在PCR進行的同時,對其過程進行監測的能力(即實時)。因此,數據可在PCR擴增過程中,而非PCR結束之后,進行收集。這為基于PCR的DNA和RNA定量方法帶來了革命性的變革。在實時熒光定量PCR(qPCR)中,反應以循環中檢測到目標擴增的時間點為特征,而非在一定循環數后目標分子累計的擴增量。目標核酸的起始拷貝數越高,則會越快觀察到熒光的顯著增加。相反,終點法檢測(也稱“讀板檢測”)測量的是PCR循環結束時累計的PCR產物量。
       
        實時熒光定量PCR儀注意事項:
        1.在實驗過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過程中,注意避免mRNA斷裂。
        2.為了防止非特異性擴增,必須設陰性對照。
        3.內參的設定:主要為了用于靶RNA的定量。常用的內參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應體系中擴增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差。
        4.PCR不能進入平臺期,出現平臺效應與所擴增的目的基因的長度、序列、二級結構以及目標DNA起始的數量有關。故對于每一個目標序列出現平臺效應的循環數,均應通過單獨實驗來確定。
        5.防止DNA的污染:采用DNA酶處理RNA樣品,在可能的情況下,將PCR引物置于基因的不同外顯子,以消除基因和mRNA的共線性。
        6.所有的玻璃器皿均應在使用前于180℃的高溫下干烤6hr或更長時間。
        7.塑料器皿可用0.1%DEPC水浸泡或用氯仿沖洗(注意:有機玻璃器具因可被氯仿腐蝕,故不能使用)。
        8.有機玻璃的電泳槽等,可先用去污劑洗滌,雙蒸水沖洗,乙醇干燥,再浸泡在3%H2O2室溫10min,然后用0.1%DEPC水沖洗,晾干。
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